香港公司未及时配合秘书公司完成尽职调查，则会影响香港公司的运营。

每一家香港公司都要进行尽职调查，供政府随时进行查阅，如果香港未及时配合秘书公司完成尽职调查，则会影响香港公司的运营。
要求公司履行的责任：1、在相关公司香港注册办事处或指定地点存放重要控制人登记册（"SCR"）；2、采取合理步骤确定公司的重要控制人，包括发出通知并获取所需的详细资料；重要控制人可以是自然人或法人。3、在SCR中填写其重要控制人的详细数据，包括姓名，地址，身份证号码，成为控制人的日期以及对公司所施加的控制的性质等详细数据。4、更新SCR中所需的详细资料；
5、向执法人员及重要控制人提供SCR及其副本以供查阅
公司注册处《公司備存重要控制人登記冊指引》P31 页 9.1.1 条例规定凡未有履行配合尽职调查责任， 即属刑事罪行。有关公司及其每名责任人可各处第 4 级罚款 (即 25,000 元 )。如情况适用， 另每日各处罚款 700 元 。如果没有在规定的时间内办理，企业还将被列入异常经营或被除名。 

由此可以看出，香港作为世界最重要的金融中心之一，在吸引外来投资时，也非常注意引入资金的安全，并且对香港公司的实际控制人信息收集也非常全面，这也使得香港成为最安全的金融中心之一。